Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM198BQ6UWH4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM198BQ6UWH4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms