Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA5Q6Q788 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms