Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LETMD1Q6P1Q0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms