Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFCAB12Q6NXP0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms