Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms