Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NANOGP8Q6NSW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms