Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms