Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SHEQ5VZ18 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms