Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf53Q5VUE5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms