Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC7Q5VTL7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC7Q5VTL7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNDC7Q5VTL7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms