Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms