Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC158Q5M9N0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC158Q5M9N0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms