Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ODF2Q5BJF6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms