Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNI3KQ59H18 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms