Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms