Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA8Q53HL2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms