Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms