Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTXN3Q4LDR2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTXN3Q4LDR2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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