Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q4G0T1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q4G0T1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q4G0T1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q4G0T1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q4G0T1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q4G0T1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q4G0T1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms