Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NBPF1Q3BBV0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms