Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM71Q2Q1W2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms