Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LAMA3Q16787 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA3Q16787 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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