Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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