Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms