Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKN2Q16513 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKN2Q16513 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms