Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD8Q15843 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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