Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VAMP3Q15836 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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