Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PUM3Q15397 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
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