Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRF4Q15306 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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