Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDK3Q15120 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms