Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCOLCEQ15113 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCOLCEQ15113 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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