Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCF4Q15080 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NCF4Q15080 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms