Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHD4Q14839 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
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