Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO1Q147U7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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