Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMC1AQ14683 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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