Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCARF1Q14162 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms