Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL9A3Q14050 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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