Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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COL4A6Q14031 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL4A6Q14031 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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