Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
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CNGB1Q14028 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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