Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1A4Q13733 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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