Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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