Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMS2P3Q13401 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PMS2P3Q13401 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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