Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCGB2A2Q13296 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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SCGB2A2Q13296 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SCGB2A2Q13296 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SCGB2A2Q13296 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SCGB2A2Q13296 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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