Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2BQ13224 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2BQ13224 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
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