Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CBX3Q13185 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX3Q13185 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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