Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACACAQ13085 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms