Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIK3Q13003 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK3Q13003 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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