Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMARCB1Q12824 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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