Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TWF1Q12792 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TWF1Q12792 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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