Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC15Q0P6D6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms